（1）種公獒的選擇 常言道”母好好一窩，公好好一坡“。藏獒也不例外，特別是在遺傳藏獒原始的野性方面，種公獒起著決定性的作用。因此，對種公獒的綜合要求比母獒高。種公獒等級應為特優級，年齡在2-5歲，體質健壯，體型完美，配種能力強，對后代品質影響大。
在選擇種公獒時，不僅要重視體型、體重，還要重視毛色、毛型、氣質品味的表現。就毛色來講，無論什么色型，都必須純正，堅決不能毛色混雜的公獒。
（2）種母獒的選擇 母獒的優劣對后代的影響也是很大的。一是遺傳物質50%來自母獒。二是仔獒身體的營養完全來自母獒。常言道“母壯子肥“，健康的母獒對后代的發育起著決定性的作用。因此，對母獒的選擇也是十分重要的。參與繁殖的母獒必須是特優級和優級的個體，并且要求毛色純正，體質較好，體況中等。
2.選配的方法 在繁殖藏獒時，為了保持或恢復其原始特性，應對公獒和種母獒分別進行選擇，最好選擇性狀表現好、具有原始特征、親緣關系較遠的種公獒和種母獒進行交配。
（1）以保持和鞏固原始特性為目的選配 這種選配是保持血統的選配。采用的方法是近交育種的方法。即先選擇1只或幾只近親的、有很好育種價值的優秀公獒作為品系育種的主要原始個體，把它同幾只在家系群中選出的最好的母獒交配。交配后得到的后代，選擇其中最優良的進行近交繁殖。為了防止近交程度增加過快而發生近交衰退，近交后橫交選育時可采用半同胞兄妹選配。經過3-4代的交配，可以得到與祖先同樣優良的，甚至超過祖先的一定數量的藏獒群。如將可能存在紅棕色或純白色隱形基因的個體各自進行交配，再橫交分離，可能會培育出紅棕色或者純白色的個體，再將紅棕色或純白色的個體進行純種繁育，就能培育出較多的紅棕色、純白色的個體。
（2）等級選配 按照藏獒地方標準對種公獒和種母獒都進行等級評定，確定等級后再按照實際情況對種獒進行選配?？偟脑瓌t是公獒的等級要平于種母獒或高于種母獒，絕不能倒置。以培育優秀種獒為目的選配，每世代主配公獒都應達到特優級。
（3）異質選配 異質選配是種公獒或種母獒都很優秀，只是在某一方面性狀表現不理想，而另一方面性狀表現又很好，將公、母獒雙方選配在一起。雙方不理想的性狀可以由另一方彌補，它們的后代可能更完美，這種選配方法稱為異質選配。異質選配可以使基因重組后，后代表現型非常完美。例如某一公獒在體型、頭型、嘴型、毛色、骨量都表現得出類拔萃，只是耳形不理想；而某一種母獒其他地方都很優秀，耳形特別好。只是骨量欠佳，將它們選配在一起，它們的缺陷都得到彌補，后代個體可能耳形也好，骨量也大，更出類拔萃。
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